Un ejemplo es la compilación de trabajos publicados en el primer número de Estudios Históricos, la revista del Museo.
En el mismo sentido, se ha promocionado la investigación ofreciendo ayudas económicas. En las convocatorias participaron tanto especialistas como estudiantes. Los trabajos podían analizar cualquier apartado histórico siempre que estuviera relacionado con el ámbito de la crisis de la sociedad tradicional vasca entre 1808 y 1841.
Éstos son los ganadores de las convocatorias (1991-1998.)
* 1991. Michael Kasper. Homenaje "La guerrilla en Gipuzkoa (1808 - 1835)"
* 1992. La Universiad de Oñate y la crisis de la sociedad tradicional en Euskal Herria (1814-1842). Juan Antonio Morales.
* 1993. Deba Arroko Jenderia. Bilakaera, demografia eta bizimodua (1770-1830). Jose Maria Uriarte.
* 1994. Boletín Oficial de Gipuzkoa (1834-1841).
* 1995. La Guerra de la Convención y la desarticulación social de Gipuzkoa. Juan Carlos Mora y David Zapirain.
* 1996. Guerra, tráfico marítimo y defensa costera: Euskal Herria (1789-1841). Francisco Manuel Vargas.
* 1997. Una aproximación al fenómeno de la enajenación de los comunales guipuzcoanos a principios del siglo XIX: Las uniones de Enirio-Aralar e Insusti (Gipuzkoa). Alfredo Moraza.
* 1998. Frantses okupazioa Gasteizko hirian independentzia gudan (1808-1814). Gorka Urtasun y Maider Gorostizaga.